Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1140940392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]317VRGDDAHEA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.24
VIR1140952392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]329FLNIKGPEL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.21
VIR1140953392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]330LNIKGPELL DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304 5 0.25
VIR1140960392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]337LLNKFVGET DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5 0.28
VIR1140964392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]341FVGETERHI DRB1_0101 1 0.31
VIR1140972392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]349IRLIFQRAR DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 23 0.43
VIR1140991392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]368VFFDEMDSI DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.22
VIR1140999392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]376IFRTRGTGV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.22
VIR1141000392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]377FRTRGTGVS DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 21 0.30
VIR1141026392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]403VEGLENVIV DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.41
VIR1141032392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]409VIVIGASNR DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR1141033392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]410IVIGASNRE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1304 13 0.23
VIR1141034392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]411VIGASNRED DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_1304 3 0.24
VIR1141035392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]412IGASNREDM DRB1_0301 1 0.26
VIR1141049392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]426LRPGRLDVK DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.25
VIR1141056392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]433VKIKIERPD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.28
VIR1141058392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]435IKIERPDAE DRB1_0421 1 0.30
VIR1141071392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]448IYSKYLTEF DRB1_0813 1 0.28
VIR1141079392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]456FLPVHADDL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.24
VIR1141082392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]459VHADDLAEF DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.27
VIR1141123392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]500YANGDKEVM DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.21
VIR1141130392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]507VMYFKDFNS DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.28
VIR1141132392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]509YFKDFNSGA DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.99
VIR1141141392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]518MIQNVVDRA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426 6 0.31
VIR1141165392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]542LRIQHLLDS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 49 0.28
VIR1141193392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]570WARISGKKG DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1141207392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]584IRTLVTGKS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 42 0.20
VIR1141210392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]587LVTGKSSSA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 6 0.26
VIR1141222392432289 YP 006473333.1 ATPase[MycobacteriumtuberculosisKZN605]599IDTESNLGQ DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.32
VIR1141251392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]27LAIVSRIFF DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.28
VIR1141253392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]29IVSRIFFSG DRB1_0806 1 0.46
VIR1141270392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]46VSQLGTEAA DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0426 4 0.27
VIR1141279392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]55VVIYFARDI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 34 0.31
VIR1141280392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]56VIYFARDIV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.30
VIR1141281392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]57IYFARDIVR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.33
VIR1141282392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]58YFARDIVRI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 10 0.36
VIR1141283392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]59FARDIVRIL DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.34
VIR1141294392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]70WLHGLVVKA DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.27
VIR1141295392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]71LHGLVVKAH DRB1_0401, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 20 0.28
VIR1141298392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]74LVVKAHRNT DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.27
VIR1141299392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]75VVKAHRNTD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.28
VIR1141300392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]76VKAHRNTDY DRB1_0402, DRB1_0421 2 0.27
VIR1141308392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]84YRLGWYVII DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 9 0.28
VIR1141313392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]89YVIIGTIPI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 50 0.23
VIR1141314392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]90VIIGTIPIC DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.25
VIR1141315392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]91IIGTIPICI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR1141324392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]100LGLFFKDDI DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 8 0.28
VIR1141326392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]102LFFKDDIRS DRB1_0402 1 0.28
VIR1141327392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]103FFKDDIRSG DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.28
VIR1141328392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]104FKDDIRSGV DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.28
VIR1141332392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]108IRSGVRNLW DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.36
VIR1141346392432268 YP 006473312.1 hypotheticalproteinTBXG 001828[MycobacteriumtuberculosisKZN605]122LVVFSGVIA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 16 0.30
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