Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1129854392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1646LLALGGRFI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.23
VIR1129861392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1653FIEIGKRDI DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 9 0.29
VIR1129869392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1661IYSNTRLEL DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 11 0.40
VIR1129870392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1662YSNTRLELL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.30
VIR1129891392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1683LGLMSVSHP DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813 6 0.23
VIR1129902392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1694VRELLSTVY DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.25
VIR1129906392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1698LSTVYRLTV DRB1_1506 1 0.30
VIR1129909392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1701VYRLTVEGV DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 10 0.29
VIR1129910392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1702YRLTVEGVL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.30
VIR1129912392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1704LTVEGVLPM DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.21
VIR1129917392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1709VLPMPQSTH DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0806, DRB1_0813 6 0.21
VIR1129920392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1712MPQSTHYPL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.29
VIR1129935392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1727IRVMGAAEH DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 41 0.30
VIR1129947392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1739LILDVPHAG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_1107 10 0.21
VIR1129968392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1760VFRSDGSYI DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.22
VIR1129969392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1761FRSDGSYII DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.22
VIR1129984392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1776LGLFLAEKM DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.25
VIR1129986392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1778LFLAEKMAN DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 19 0.26
VIR1130016392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1808IELVRAIGS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.28
VIR1130018392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1810LVRAIGSDV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.29
VIR1130076392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1868IERDWAPKA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
VIR1130085392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1877YGAWQLHRA DRB1_1114, DRB1_1323 2 0.28
VIR1130088392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1880WQLHRATAD DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304 6 0.28
VIR1130111392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1903LVGSPGQGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.21
VIR1130126392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1918WLDTFTHWR DRB1_0421, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.27
VIR1130130392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1922FTHWRRAQD DRB1_0801 1 0.25
VIR1130133392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1925WRRAQDLPA DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 11 0.22
VIR1130149392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1941WGQIGRAIA DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 8 0.28
VIR1130152392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1944IGRAIAFAE DRB1_1304 1 0.24
VIR1130173392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1965YAFETLLRH DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0817 3 0.99
VIR1130175392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1967FETLLRHNR DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR1130178392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1970LLRHNRAYS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 31 0.29
VIR1130196392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1988WLTAFAQHS DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.20
VIR1130200392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1992FAQHSPFAE DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304 3 0.29
VIR1130210392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2002FQSLGQNRS DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 17 0.28
VIR1130239392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2031LRRLLSKQV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 38 0.28
VIR1130242392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2034LLSKQVGLI DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.28
VIR1130249392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2041LILRRTIDT DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.23
VIR1130250392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2042ILRRTIDTD DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.26
VIR1130251392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2043LRRTIDTDR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.26
VIR1130274392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2066LRARVEAET DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.29
VIR1130278392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2070VEAETGIRI DRB1_0102 1 0.37
VIR1130284392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2076IRISATEIN DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1304 20 0.99
VIR1130295392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2087VRGLADLMC DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.21
VIR1130301392432873 YP 006473917.1 polyketidesynthasepks5[MycobacteriumtuberculosisKZN605]2093LMCDKLAAD DRB1_0301 1 0.28
VIR1130309392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]1MSFLLVEPD DRB1_0410 1 0.25
VIR1130314392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]6VEPDLVTAA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 10 0.24
VIR1130370392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]62FQALNARAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.34
VIR1130373392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]65LNARAATFH DRB1_0402, DRB1_0813 2 0.27
VIR1130380392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]72FHAEFVSLL DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.28
VIR1130384392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]76FVSLLNGGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1502 18 0.28
VIR1130395392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]87YTGAEAASV DRB1_0101 1 0.32
VIR1130403392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]95VSSMQALLD DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0817, DRB1_1321 4 0.28
VIR1130522392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]214FGNGGNGGS DRB1_0305 1 0.28
VIR1130607392432766 YP 006473810.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumtuberculosisKZN605]299LVGNGGAGG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
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