Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1119420392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]140FAVVFVHDQ DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 11 0.28
VIR1119422392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]142VVFVHDQSD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.28
VIR1119424392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]144FVHDQSDYA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 10 0.28
VIR1119431392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]151YARMEAARR DRB1_0101, DRB1_0408, DRB1_0802, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.33
VIR1119441392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]161FVANVSHEL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.28
VIR1119453392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]173VGAMALLAE DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 6 0.24
VIR1119473392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]193VRRFAEKVL DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 4 0.20
VIR1119480392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]200VLIEANRLG DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.45
VIR1119481392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]201LIEANRLGD DRB1_1321 1 0.51
VIR1119490392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]210MVAELIELS DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 8 0.26
VIR1119494392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]214LIELSRLQG DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321 7 0.39
VIR1119500392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]220LQGAERLPN DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1506 11 0.33
VIR1119517392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]237IVSEAISRH DRB1_0401, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 5 0.92
VIR1119522392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]242ISRHKVAAD DRB1_1304 1 0.80
VIR1119544392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]264LRVLGDQTL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.31
VIR1119553392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]273LVTALANLV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1506 8 0.29
VIR1119554392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]274VTALANLVS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 13 0.23
VIR1119557392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]277LANLVSNAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 12 0.21
VIR1119567392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]287YSPRGSLVS DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101 7 0.24
VIR1119573392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]293LVSISRRRR DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 24 0.27
VIR1119574392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]294VSISRRRRG DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 9 0.26
VIR1119576392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]296ISRRRRGAN DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 4 0.24
VIR1119585392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]305IEIAVTDRG DRB1_0410, DRB1_0421 2 0.31
VIR1119605392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]325FERFFRGDK DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1307 3 0.37
VIR1119608392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]328FFRGDKARS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 19 0.40
VIR1119609392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]329FRGDKARSR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.48
VIR1119629392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]349VKHVAANHD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.24
VIR1119640392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]360IRVWSKPGT DRB1_0301, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 22 0.29
VIR1119652392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]372FTLALPALI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.21
VIR1119663392430908 YP 006471952.1 twocomponentsystemsensorhistidinekinasesenX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]383YHDDERPEQ DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.28
VIR1119699392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]17LAFLLRKEG DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3 0.32
VIR1119701392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]19FLLRKEGFE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.27
VIR1119702392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]20LLRKEGFEA DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 9 0.28
VIR1119712392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]30VVTDGPAAL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_1107 10 0.20
VIR1119733392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]51LDLMLPGMS DRB1_0804 1 0.25
VIR1119745392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]63VCKQLRARS DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.28
VIR1119757392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]75VIMVTARDS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 33 0.30
VIR1119770392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]88VVGLELGAD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1321 4 0.58
VIR1119780392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]98YVTKPYSAR DRB1_0813 1 0.33
VIR1119790392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]108LIARIRAVL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.40
VIR1119791392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]109IARIRAVLR DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.28
VIR1119818392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]136VRMDVERHV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.28
VIR1119822392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]140VERHVVSVN DRB1_1304 1 0.59
VIR1119838392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]156LKEFDLLEY DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.31
VIR1119841392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]159FDLLEYLMR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.24
VIR1119844392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]162LEYLMRNSG DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.37
VIR1119846392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]164YLMRNSGRV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1502 7 0.38
VIR1119847392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]165LMRNSGRVL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.35
VIR1119848392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]166MRNSGRVLT DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 17 0.36
VIR1119854392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]172VLTRGQLID DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.30
VIR1119865392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]183WGADYVGDT DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.30
VIR1119876392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]194LDVHVKRLR DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.99
VIR1119878392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]196VHVKRLRSK DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.28
VIR1119880392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]198VKRLRSKIE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 6 0.28
VIR1119883392430909 YP 006471953.1 twocomponentsystemsensorproteinregX3[MycobacteriumtuberculosisKZN605]201LRSKIEADP DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.29
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VIR1127588392433056 YP 006474100.1 drugs-transporttransmembraneATP-bindingproteinABCtransporter[Mycobacteriumtuberculosis459IVQAQRWAE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.26
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