Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1109036297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]247VYIASRTID DRB1_1304 1 0.36
VIR1109037297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]248YIASRTIDL DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.41
VIR1109045297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]256LVAKSVIWR DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.28
VIR1109046297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]257VAKSVIWRL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR1109066297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]277VLGYWVTSQ DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 18 0.35
VIR1109067297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]278LGYWVTSQA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 9 0.39
VIR1109079297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]290MQLCHHLHG DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.28
VIR1109085297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]296LHGGMGMDV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.24
VIR1109089297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]300MGMDVTYPM DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 16 0.28
VIR1109097297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]308MHRYYSTIK DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.99
VIR1109118297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]329LELLGARCS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 24 0.28
VIR1109120297636216 ZP 06953996.1 putativeacyl-CoAdehydrogenase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]331LLGARCSLT DRB1_0102 1 0.29
VIR1109121297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1MSIRSLGYL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.29
VIR1109123297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]3IRSLGYLRI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.28
VIR1109128297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]8YLRIEATDM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0813, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 19 0.28
VIR1109129297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]9LRIEATDMA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1322 17 0.28
VIR1109139297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]19WREYGLKVL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1502 4 0.24
VIR1109161297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]41YLRMDDFPA DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.28
VIR1109162297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]42LRMDDFPAR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.28
VIR1109186297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]66WECANAEGL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
VIR1109197297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]77IRNRLDLEG DRB1_0402, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 5 0.37
VIR1109208297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]88YKEATAAEL DRB1_0101 1 0.25
VIR1109224297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]104MIRFADPSG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.32
VIR1109225297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]105IRFADPSGN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1304 11 0.45
VIR1109235297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]115LEVFHGTAL DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.22
VIR1109237297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]117VFHGTALEH DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.23
VIR1109252297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]132YGHRFVTGE DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817 3 0.32
VIR1109256297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]136FVTGEQGMG DRB1_0309 1 0.30
VIR1109277297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]157LHFYRDVLG DRB1_1506 1 0.29
VIR1109279297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]159FYRDVLGFR DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.31
VIR1109280297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]160YRDVLGFRL DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.30
VIR1109292297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]172MRLPPQMVG DRB1_0301, DRB1_0309 2 0.28
VIR1109309297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]189WLRFFGCNP DRB1_0101, DRB1_1502 2 0.28
VIR1109310297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]190LRFFGCNPR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 25 0.27
VIR1109312297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]192FFGCNPRHH DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.28
VIR1109313297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]193FGCNPRHHS DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 9 0.28
VIR1109333297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]213IVHLMVEVE DRB1_0301, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 15 0.25
VIR1109348297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]228LCLDRALRR DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 8 0.26
VIR1109354297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]234LRRKVPMSA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 38 0.21
VIR1109358297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]238VPMSATLGR DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426 9 0.36
VIR1109364297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]244LGRHVNDLM DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.42
VIR1109371297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]251LMLSFYMKT DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.25
VIR1109373297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]253LSFYMKTPG DRB1_0813 1 0.23
VIR1109375297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]255FYMKTPGGF DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.21
VIR1109399297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]279WIARESTAV DRB1_0813 1 0.26
VIR1109400297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]280IARESTAVS DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 6 0.25
VIR1109410297636242 ZP 06954022.1 biphenyl-2,3-diol1,2-dioxygenasebphC[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]290WGHDFTVGA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 12 0.28
VIR1109439297636286 ZP 06954066.1 hypotheticalproteinMtubK4 19270[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]27WTADPIIGV DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.32
VIR1109501297636286 ZP 06954066.1 hypotheticalproteinMtubK4 19270[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]89LSARVAWMS DRB1_0402 1 0.28
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VIR1109517297636286 ZP 06954066.1 hypotheticalproteinMtubK4 19270[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]105ILVIADLAR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
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VIR1116287392430825 YP 006471869.1 serine/threonine-proteinkinasepknG[MycobacteriumtuberculosisKZN605]260ILPALSYLH DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.26
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