Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1099423297635311 ZP 06953091.1 RNApolymerasesigmafactor[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]495VYGVTRERI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.23
VIR1099424297635311 ZP 06953091.1 RNApolymerasesigmafactor[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]496YGVTRERIR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.22
VIR1099431297635311 ZP 06953091.1 RNApolymerasesigmafactor[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]503IRQIESKTM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.31
VIR1099442297635311 ZP 06953091.1 RNApolymerasesigmafactor[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]514LRHPSRSQV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.23
VIR1099460297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]12LRTIYDLEE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3 0.25
VIR1099471297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]23VTPLRARIA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 5 0.27
VIR1099474297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]26LRARIAERL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.26
VIR1099496297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]48MERDGLLRV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.30
VIR1099502297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]54LRVAGDRHL DRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.32
VIR1099504297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]56VAGDRHLEL DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.48
VIR1099552297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]104WEHVMSEDV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.25
VIR1099555297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]107VMSEDVERR DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.20
VIR1099560297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]112VERRLVKVL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 5 0.28
VIR1099564297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]116LVKVLNNPT DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.27
VIR1099565297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]117VKVLNNPTT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0410, DRB1_0423 4 0.28
VIR1099600297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]152VRLTELPAG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107, DRB1_1128 4 0.46
VIR1099626297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]178IDLITRLKD DRB1_1321 1 0.24
VIR1099637297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]189VVPNARVTV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 29 0.35
VIR1099638297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]190VPNARVTVE DRB1_0410 1 0.33
VIR1099643297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]195VTVETTPGG DRB1_0421 1 0.27
VIR1099653297635319 ZP 06953099.1 iron-dependentrepressorandactivatorideR[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]205VTIVIPGHE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.25
VIR1099674297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]4LVREVVGDV DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1107 7 0.21
VIR1099682297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]12VLRGARMSQ DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311, DRB1_1321 17 0.24
VIR1099705297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]35LGYLSEIER DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.38
VIR1099711297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]41IERGRKEPS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.51
VIR1099722297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]52LLSAICTAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.21
VIR1099723297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]53LSAICTALQ DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1307 9 0.22
VIR1099732297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]62LPLSVVLID DRB1_1321 1 0.31
VIR1099736297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]66VVLIDAGER DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.27
VIR1099737297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]67VLIDAGERM DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.27
VIR1099745297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]75MARQERLAR DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1327, DRB1_1328 7 0.44
VIR1099751297635354 ZP 06953134.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]81LARATPAGR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.49
VIR1099775297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1MMFVTGIVL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.27
VIR1099776297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]2MFVTGIVLF DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.27
VIR1099777297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]3FVTGIVLFA DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 29 0.30
VIR1099786297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]12LAILISVAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 12 0.29
VIR1099788297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]14ILISVALHE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 14 0.27
VIR1099801297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]27WVARRTGMK DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR1099802297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]28VARRTGMKV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.29
VIR1099810297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]36VRRYFVGFG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 28 0.25
VIR1099813297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]39YFVGFGPTL DRB1_0101 1 0.22
VIR1099814297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]40FVGFGPTLW DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1323, DRB1_1502 10 0.23
VIR1099815297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]41VGFGPTLWS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 18 0.23
VIR1099831297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]57YGVKAVPLG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 9 0.29
VIR1099838297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]64LGGFCDIAG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR1099862297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]88MYKQATWKR DRB1_0402, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.27
VIR1099868297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]94WKRVAVLFA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 36 0.28
VIR1099873297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]99VLFAGPGMN DRB1_0806 1 0.42
VIR1099874297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]100LFAGPGMNL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.45
VIR1099884297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]110ICLVLIYAI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.24
VIR1099886297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]112LVLIYAIAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 37 0.20
VIR1099888297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]114LIYAIALVW DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1321 7 0.23
VIR1099890297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]116YAIALVWGL DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.28
VIR1099894297635485 ZP 06953265.1 hypotheticalproteinMtubK4 15247[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]120LVWGLPNLH DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107 7 0.28
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