Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1089389297634417 ZP 06952197.1 molybdate-bindinglipoproteinmodA[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]236LARQFVAMV DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.27
VIR1089393297634417 ZP 06952197.1 molybdate-bindinglipoproteinmodA[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]240FVAMVTAAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 40 0.27
VIR1089407297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1MIRELVTTA DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 5 0.28
VIR1089408297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]2IRELVTTAA DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813 11 0.26
VIR1089459297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]53IFGRGPSGQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 7 0.37
VIR1089460297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]54FGRGPSGQA DRB1_0305 1 0.49
VIR1089487297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]81WVISYPLYG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 44 0.28
VIR1089488297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]82VISYPLYGV DRB1_0804, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 4 0.28
VIR1089491297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]85YPLYGVQQV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813 3 0.22
VIR1089516297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]110LPMLCLGAR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR1089519297634455 ZP 06952235.1 hypotheticalproteinMtubK4 10051[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]113LCLGARGWQ DRB1_0305, DRB1_1107 2 0.28
VIR1089555297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]22VVGHMKYPV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 18 0.23
VIR1089572297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]39WPNRLNLKV DRB1_0817 1 0.29
VIR1089576297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]43LNLKVLHQN DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 6 0.26
VIR1089578297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]45LKVLHQNPA DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 6 0.29
VIR1089580297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]47VLHQNPAVA DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 6 0.24
VIR1089613297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]80IEEVMTTSQ DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.30
VIR1089628297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]95YGHYGPLFI DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 18 0.30
VIR1089631297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]98YGPLFIRMA DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323 13 0.29
VIR1089634297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]101LFIRMAWHA DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 17 0.27
VIR1089635297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]102FIRMAWHAA DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.28
VIR1089636297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]103IRMAWHAAG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 31 0.36
VIR1089640297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]107WHAAGTYRI DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.29
VIR1089646297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]113YRIHDGRGG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 23 0.28
VIR1089659297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]126MQRFAPLNS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 41 0.28
VIR1089662297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]129FAPLNSWPD DRB1_0405 1 0.28
VIR1089682297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]149WPVKKKYGK DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1323 4 0.28
VIR1089688297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]155YGKKLSWAD DRB1_0801, DRB1_0817 2 0.34
VIR1089697297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]164LIVFAGNCA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 10 0.29
VIR1089698297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]165IVFAGNCAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 15 0.28
VIR1089700297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]167FAGNCALES DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 11 0.28
VIR1089724297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]191WEPDEVYWG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309 3 0.28
VIR1089731297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]198WGKEATWLG DRB1_0401, DRB1_0421 2 0.28
VIR1089756297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]223VQMGLIYVN DRB1_0301, DRB1_1107 2 0.28
VIR1089758297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]225MGLIYVNPE DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 14 0.28
VIR1089779297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]246VDIRETFRR DRB1_0402 1 0.27
VIR1089781297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]248IRETFRRMA DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3 0.28
VIR1089785297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]252FRRMAMNDV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.20
VIR1089788297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]255MAMNDVETA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 8 0.28
VIR1089799297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]266IVGGHTFGK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.26
VIR1089826297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]293LEQMGLGWK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1089829297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]296MGLGWKSSY DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.30
VIR1089833297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]300WKSSYGTGT DRB1_0101 1 0.28
VIR1089850297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]317IEVVWTNTP DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 4 0.31
VIR1089861297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]328WDNSFLEIL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR1089866297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]333LEILYGYEW DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR1089872297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]339YEWELTKSP DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.23
VIR1089874297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]341WELTKSPAG DRB1_0421 1 0.35
VIR1089884297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]351WQYTAKDGA DRB1_0305 1 0.28
VIR1089911297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]378LATDLSLRV DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0421 5 0.29
VIR1089917297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]384LRVDPIYER DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.28
VIR1089922297634474 ZP 06952254.1 catalase-peroxidase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]389IYERITRRW DRB1_0402 1 0.29
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