Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1068277297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]79VARVESRTY DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.30
VIR1068306297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]108MRSIMKDLY DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.27
VIR1068314297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]116YRGCMRGRT DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321 9 0.28
VIR1068318297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]120MRGRTMYVV DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.30
VIR1068324297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]126YVVPFCMGP DRB1_0309 1 0.31
VIR1068325297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]127VVPFCMGPL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.30
VIR1068340297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]142LGVEITDSE DRB1_0421 1 0.25
VIR1068342297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]144VEITDSEYV DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.25
VIR1068373297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]175FFVKALHSV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 8 0.28
VIR1068374297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]176FVKALHSVG DRB1_0309 1 0.28
VIR1068375297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]177VKALHSVGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 9 0.22
VIR1068394297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]196WPCSETKYI DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 5 0.28
VIR1068401297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]203YITHFPETR DRB1_0421, DRB1_1120, DRB1_1302 3 0.28
VIR1068429297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]231YSLRIASAM DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813 3 0.26
VIR1068431297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]233LRIASAMAH DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 51 0.25
VIR1068443297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]245WLAEHMLIL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.25
VIR1068448297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]250MLILKLISP DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.26
VIR1068449297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]251LILKLISPE DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1304 7 0.36
VIR1068450297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]252ILKLISPEN DRB1_0410 1 0.42
VIR1068451297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]253LKLISPENK DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.38
VIR1068461297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]263YYFAAAFPS DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.29
VIR1068476297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]278LAMLQPTIP DRB1_0102 1 0.25
VIR1068479297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]281LQPTIPGWR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.23
VIR1068486297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]288WRAETLGDD DRB1_0801 1 0.28
VIR1068497297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]299WMRFGKDGR DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 4 0.26
VIR1068498297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]300MRFGKDGRL DRB1_1506 1 0.24
VIR1068518297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]320VAPGTNWKS DRB1_0402 1 0.28
VIR1068524297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]326WKSNPNAMR DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.28
VIR1068572297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]374WYFRETETN DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 4 0.26
VIR1068574297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]376FRETETNAA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 7 0.26
VIR1068608297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]410VPISGILFG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 5 0.58
VIR1068625297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]427LVTEARDWQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.28
VIR1068657297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]459VRRDPMAML DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1506 9 0.27
VIR1068664297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]466MLPFLGYNV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.22
VIR1068667297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]469FLGYNVGDY DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.30
VIR1068694297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]496VFFVNWFRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.26
VIR1068696297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]498FVNWFRRGD DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.26
VIR1068697297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]499VNWFRRGDD DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.26
VIR1068722297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]524WIVDRIEHK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.50
VIR1068770297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]572WRQELPLIE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 9 0.28
VIR1068780297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]582WLQFVGEKL DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502 4 0.26
VIR1068783297632691 ZP 06950471.1 phosphoenolpyruvatecarboxykinase[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]585FVGEKLPTG DRB1_0309, DRB1_0421 2 0.38
VIR1068797297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1MNNLALWSR DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.24
VIR1068802297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]6LWSRPVWDV DRB1_0402, DRB1_0804 2 0.28
VIR1068810297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]14VEPWDRWLR DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3 0.28
VIR1068816297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]20WLRDFFGPA DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.28
VIR1068817297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]21LRDFFGPAA DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.29
VIR1068821297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]25FGPAATTDW DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426 4 0.26
VIR1068833297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]37VAGDFTPAA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 10 0.38
VIR1068851297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]55VVRLELPGI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 31 0.55
VIR1068852297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]56VRLELPGID DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.35
VIR1068875297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]79VSRLVIRGE DRB1_0806, DRB1_1304 2 0.31
VIR1068878297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]82LVIRGEHRD DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 5 0.31
VIR1068879297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]83VIRGEHRDE DRB1_1304 1 0.27
VIR1068880297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]84IRGEHRDEH DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.40
VIR1068903297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]107IRYGSFRRS DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4 0.99
VIR1068912297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]116FRLPAHVTS DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1323 10 0.75
VIR1068914297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]118LPAHVTSEA DRB1_0402 1 0.77
VIR1068931297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]135VLTVRVAGA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 16 0.36
VIR1068932297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]136LTVRVAGAY DRB1_0806 1 0.39
VIR1068934297632732 ZP 06950512.1 heatshockproteinhsp[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]138VRVAGAYKA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.51
VIR1068948297632833 ZP 06950613.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1MTISFSSSN DRB1_0410 1 0.21
VIR1068950297632833 ZP 06950613.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]3ISFSSSNLR DRB1_0421 1 0.27
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VIR1069116297632833 ZP 06950613.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]169LALASTHTG DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0421 3 0.28
VIR1069128297632833 ZP 06950613.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]181VEYVLNETD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.31
VIR1069130297632833 ZP 06950613.1 transcriptionalregulator[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]183YVLNETDKD DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_1321 10 0.33
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VIR1069177297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN21LAGMHAQTL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.26
VIR1069206297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN50YSLHDVELL DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 9 0.26
VIR1069208297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN52LHDVELLRQ DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.28
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VIR1069214297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN58LRQVQHLSQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 29 0.24
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VIR1069231297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN75IKRIIELTS DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 12 0.27
VIR1069234297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN78IIELTSQVE DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.36
VIR1069268297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN112VVPKSTALV DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 24 0.23
VIR1069269297632838 ZP 06950618.1 merR-familyheatshockproteintranscriptionalrepressorhspR[MycobacteriumtuberculosisKZN113VPKSTALVV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.23
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VIR1069505297632892 ZP 06950672.1 serine/threonine-proteinkinasepknG[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]231VMEYVGGQS DRB1_0804 1 0.20
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VIR1069509297632892 ZP 06950672.1 serine/threonine-proteinkinasepknG[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]235VGGQSLKRS DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.22
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VIR1069531297632892 ZP 06950672.1 serine/threonine-proteinkinasepknG[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]257LLEILPALS DRB1_1307 1 0.25
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