Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1057427375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]55VVRYCRARV DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33 0.28
VIR1057428375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]56VRYCRARVG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 17 0.28
VIR1057430375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]58YCRARVGTV DRB1_1307 1 0.28
VIR1057463375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]91YRDRGRPFL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 4 0.31
VIR1057504375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]132WSADAGPEQ DRB1_0305 1 0.29
VIR1057515375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]143IEADSVTRM DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.60
VIR1057526375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]154LLEILPAKQ DRB1_1307 1 0.99
VIR1057527375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]155LEILPAKQR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.99
VIR1057529375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]157ILPAKQREI DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.24
VIR1057537375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]165ILILRVVVG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 44 0.32
VIR1057538375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]166LILRVVVGL DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.35
VIR1057539375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]167ILRVVVGLS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 24 0.38
VIR1057540375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]168LRVVVGLSA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.39
VIR1057542375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]170VVVGLSAEE DRB1_0801, DRB1_0806 2 0.36
VIR1057543375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]171VVGLSAEET DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.49
VIR1057546375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]174LSAEETAAA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.46
VIR1057562375297688 YP 005101955.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]190VRVAQHRAL DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 17 0.41
VIR1057593375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]17WQLQGLCRG DRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 10 0.28
VIR1057595375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]19LQGLCRGMD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.29
VIR1057628375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]52MCRRCPVIE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 4 0.28
VIR1057635375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]59IEACRSHAL DRB1_0703 1 0.28
VIR1057649375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]73YGVWGGLSE DRB1_0817, DRB1_1321 2 0.29
VIR1057662375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]86LLLKGTMGR DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 29 0.26
VIR1057664375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]88LKGTMGRTR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.25
VIR1057668375297690 YP 005101957.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]92MGRTRGIRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.25
VIR1057677375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]7VPARAVGGF DRB1_0806 1 0.22
VIR1057682375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]12VGGFFEMSM DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR1057688375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]18MSMDTARAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.27
VIR1057701375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]31FQFREFLDQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1321, DRB1_1323 11 0.23
VIR1057711375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]41WMVARVSLV DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0813, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307 14 0.24
VIR1057712375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]42MVARVSLVP DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1506 9 0.24
VIR1057716375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]46VSLVPTLLV DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311 14 0.27
VIR1057718375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]48LVPTLLVSI DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 5 0.28
VIR1057722375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]52LLVSIPFTV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 7 0.21
VIR1057723375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]53LVSIPFTVL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.21
VIR1057734375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]64FTLNILLRE DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 5 0.21
VIR1057736375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]66LNILLREIG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.26
VIR1057738375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]68ILLREIGAA DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.26
VIR1057740375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]70LREIGAADL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.22
VIR1057767375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]97VLVVAGAGA DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.25
VIR1057768375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]98LVVAGAGAT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.25
VIR1057769375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]99VVAGAGATA DRB1_0102 1 0.42
VIR1057770375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]100VAGAGATAI DRB1_0102 1 0.39
VIR1057791375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]121IDAMRVLGI DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.28
VIR1057794375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]124MRVLGIDPI DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 21 0.28
VIR1057796375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]126VLGIDPIQR DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.31
VIR1057797375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]127LGIDPIQRL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.32
VIR1057802375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]132IQRLVVPRV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 28 0.23
VIR1057805375297769 YP 005102036.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]135LVVPRVLAS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 44 0.23
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