Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1047721375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]952YRVELGEIE DRB1_0421 1 0.28
VIR1047723375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]954VELGEIEAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.36
VIR1047738375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]969VHAAAATVL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.25
VIR1047752375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]983VLAAAVCVD DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 5 0.25
VIR1047776375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1007LVPAHMIPR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1047792375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1023IPFTDSGKI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.35
VIR1047849375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1080VGVHDDFFA DRB1_1506 1 0.28
VIR1047868375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1099VVAGIRRWL DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 8 0.26
VIR1047872375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1103IRRWLDSPS DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.25
VIR1047881375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1112LMVADMFAA DRB1_1506 1 0.31
VIR1047882375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1113MVADMFAAR DRB1_0301, DRB1_0309 2 0.32
VIR1047886375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1117MFAARTIAA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 11 0.45
VIR1047887375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1118FAARTIAAL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 4 0.30
VIR1047911375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1142LVAEVYLEI DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 8 0.27
VIR1047915375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1146VYLEIANMT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 5 0.28
VIR1047916375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1147YLEIANMTS DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305 11 0.29
VIR1047919375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1150IANMTSADV DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5 0.33
VIR1047928375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1159MAALDPIEQ DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1321 5 0.30
VIR1047942375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1173FKPWVKRFT DRB1_0801, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.28
VIR1047945375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1176WVKRFTGTD DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1321 7 0.28
VIR1047946375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1177VKRFTGTDK DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.29
VIR1047958375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1189VLVFPHAGG DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3 0.28
VIR1047971375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1202YRWLAKSLV DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 15 0.28
VIR1047973375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1204WLAKSLVAN DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 4 0.27
VIR1047986375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1217FVVQYPQRA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 26 0.99
VIR1047987375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1218VVQYPQRAD DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 8 0.99
VIR1048027375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1258FGHCMGAIV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR1048031375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1262MGAIVAFEF DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.32
VIR1048034375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1265IVAFEFARL DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.30
VIR1048037375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1268FEFARLAER DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.29
VIR1048048375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1279VPVRALWAS DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804 3 0.27
VIR1048050375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1281VRALWASSG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 7 0.27
VIR1048077375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1308VLADMVDLG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.23
VIR1048084375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1315LGGTDPVLL DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 3 0.25
VIR1048097375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1328FVELLVPAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 13 0.27
VIR1048098375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1329VELLVPAVK DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.26
VIR1048101375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1332LVPAVKADY DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 32 0.27
VIR1048109375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1340YRALSGYSC DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.29
VIR1048121375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1352VRIRANIHA DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 39 0.36
VIR1048123375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1354IRANIHAVG DRB1_0806, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.39
VIR1048143375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1374LTSWETHTS DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 15 0.28
VIR1048164375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1395FYLNDHLDA DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323 18 0.30
VIR1048165375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1396YLNDHLDAV DRB1_0305, DRB1_0309 2 0.29
VIR1048173375295803 YP 005100070.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1404VARMVSADV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 7 0.42
VIR1048178375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]4LTIGDQFPA DRB1_1107 1 0.22
VIR1048208375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]34YFTTITSDE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421 4 0.36
VIR1048209375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]35FTTITSDEH DRB1_0401, DRB1_0405 2 0.25
VIR1048212375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]38ITSDEHPGK DRB1_0305, DRB1_1107 2 0.31
VIR1048221375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]47WRVVFFWPK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR1048223375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]49VVFFWPKDF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 33 0.28
VIR1048227375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]53WPKDFTFVC DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 5 0.28
VIR1048231375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]57FTFVCPTEI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.28
VIR1048259375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]85VSIDSEFAH DRB1_1107 1 0.34
VIR1048265375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]91FAHFQWRAQ DRB1_1114, DRB1_1323 2 0.29
VIR1048268375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]94FQWRAQHND DRB1_0801, DRB1_0817 2 0.28
VIR1048270375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]96WRAQHNDLK DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.24
VIR1048282375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]108FPMLSDIKR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.26
VIR1048284375295755 YP 005100022.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]110MLSDIKREL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
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