Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1037536375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]104VLAASGHLV DRB1_0102 1 0.29
VIR1037537375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]105LAASGHLVF DRB1_0703 1 0.37
VIR1037553375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]121IVAVHLLGR DRB1_0301, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.26
VIR1037556375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]124VHLLGRPLG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 18 0.27
VIR1037558375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]126LLGRPLGRL DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.28
VIR1037566375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]134LVDRDNAVE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.25
VIR1037578375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]146LQPYQVRVI DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 20 0.29
VIR1037581375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]149YQVRVICRP DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 10 0.28
VIR1037583375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]151VRVICRPKA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 36 0.28
VIR1037585375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]153VICRPKAET DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.28
VIR1037610375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]178LRGIRTGPA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 31 0.23
VIR1037629375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]197LLMVGHTPA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1107 8 0.25
VIR1037630375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]198LMVGHTPAK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.25
VIR1037631375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]199MVGHTPAKL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 19 0.25
VIR1037639375296395 YP 005100662.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]207LERLVAELS DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0423 4 0.25
VIR1037673375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]15VLTRCQMSF DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.28
VIR1037679375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]21MSFVVTIPE DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_1321 3 0.28
VIR1037681375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]23FVVTIPEAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.28
VIR1037696375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]38LAGIGSTIG DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423 3 0.24
VIR1037750375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]92FHEQFVRAL DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 4 0.28
VIR1037754375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]96FVRALTAGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 43 0.27
VIR1037755375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]97VRALTAGAG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0806, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.30
VIR1037782375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]124VINAPALAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.27
VIR1037795375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]137LIGNGANGA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426 8 0.25
VIR1037817375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]159IGNGGAGGS DRB1_1107 1 0.25
VIR1038006375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]348IGLVGNGGA DRB1_0404, DRB1_0423 2 0.27
VIR1038008375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]350LVGNGGAGG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR1038009375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]351VGNGGAGGS DRB1_1107 1 0.24
VIR1038052375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]394LVGAGGAGG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR1038139375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]481LVGNGGNGG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR1038166375296388 YP 005100655.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]508LLGKNGMNG DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.27
VIR1038169375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]1MNVHGCPRI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 10 0.28
VIR1038171375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]3VHGCPRIAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.28
VIR1038195375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]27YRWFVPKTT DRB1_0101, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.28
VIR1038197375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]29WFVPKTTRA DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408 3 0.31
VIR1038198375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]30FVPKTTRAQ DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 26 0.31
VIR1038214375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]46FWRLLGAST DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.25
VIR1038251375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]83LRKAAGLLN DRB1_0102, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.31
VIR1038286375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]118LRPFDVQLL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33 0.37
VIR1038291375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]123VQLLGALRM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 48 0.20
VIR1038293375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]125LLGALRMLA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 22 0.26
VIR1038297375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]129LRMLAGDVI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.26
VIR1038299375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]131MLAGDVIEM DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.30
VIR1038300375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]132LAGDVIEMA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.36
VIR1038304375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]136VIEMATGEG DRB1_0410 1 0.47
VIR1038324375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]156YALAGRHVH DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 9 0.27
VIR1038326375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]158LAGRHVHVV DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.25
VIR1038361375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]193WITADSTPD DRB1_0405 1 0.99
VIR1038362375296385 YP 005100652.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]194ITADSTPDE DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.99
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