Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR1026237375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]252LIIAFVVLG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 40 0.22
VIR1026238375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]253IIAFVVLGR DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 23 0.26
VIR1026241375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]256FVVLGRHLE DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 22 0.30
VIR1026242375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]257VVLGRHLEA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 20 0.43
VIR1026248375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]263LEARATGKA DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.74
VIR1026273375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]288LLVDGQELL DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.25
VIR1026281375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]296LVPVDQVQV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703 4 0.28
VIR1026282375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]297VPVDQVQVG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.29
VIR1026292375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]307LVRVRPGEK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.22
VIR1026293375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]308VRVRPGEKI DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 6 0.30
VIR1026295375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]310VRPGEKIPV DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506 17 0.37
VIR1026318375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]333MLTGESVPV DRB1_0102 1 0.23
VIR1026334375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]349VAGATVNLD DRB1_0410 1 0.28
VIR1026347375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]362VRATAVGAD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.35
VIR1026358375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]373LAQIVRLVE DRB1_0817, DRB1_1321 2 0.23
VIR1026361375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]376IVRLVEQAQ DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322 6 0.22
VIR1026375375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]390VQRLADRVS DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 4 0.38
VIR1026386375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]401FVPAVIGVA DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323 14 0.29
VIR1026391375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]406IGVAVATFA DRB1_0102 1 0.27
VIR1026395375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]410VATFAGWTL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.34
VIR1026398375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]413FAGWTLIAA DRB1_1101 1 0.27
VIR1026418375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]433VLIIACPCA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506 27 0.28
VIR1026419375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]434LIIACPCAL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0410, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 29 0.28
VIR1026436375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]451MVGTGRGAE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.47
VIR1026445375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]460LGILVKGGE DRB1_0301, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 14 0.28
VIR1026449375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]464VKGGEVLEA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 12 0.30
VIR1026464375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]479VVFDKTGTL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.24
VIR1026477375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]492MRVTDVIAG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.28
VIR1026494375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]509LRLAAAVES DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 46 0.20
VIR1026541375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]556VNGGPVVVG DRB1_0301 1 0.26
VIR1026559375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]574LVLPDHLAA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 15 0.28
VIR1026560375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]575VLPDHLAAA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.30
VIR1026581375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]596FVGQDGQVV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1120, DRB1_1302 4 0.28
VIR1026582375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]597VGQDGQVVG DRB1_0301 1 0.28
VIR1026592375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]607LAVADTVKD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.39
VIR1026605375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]620VVGRLHAMG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.27
VIR1026606375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]621VGRLHAMGL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.27
VIR1026612375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]627MGLQVAMIT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR1026614375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]629LQVAMITGD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.26
VIR1026634375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]649VGIEKVLAE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 10 0.45
VIR1026636375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]651IEKVLAEVL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.34
VIR1026640375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]655LAEVLPQDK DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.21
VIR1026643375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]658VLPQDKVAE DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 4 0.21
VIR1026682375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]697IAIGTGTDV DRB1_0102 1 0.23
VIR1026690375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]705VAIEASDIT DRB1_0401 1 0.44
VIR1026707375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]722VVRAIELSR DRB1_1128, DRB1_1305, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.37
VIR1026708375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]723VRAIELSRQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 20 0.37
VIR1026722375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]737YQNLGWAFG DRB1_0405 1 0.25
VIR1026729375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]744FGYNTAAIP DRB1_0101 1 0.28
VIR1026747375297240 YP 005101507.1 unnamedproteinproduct[MycobacteriumtuberculosisKZN4207]762VVAGAAMGF DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 11 0.26
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