OUTPUT OF SPECTRAL REPEAT FINDER
View Fourier Spectrum of Entire DNA Sequence  FFT




Pattern Searched Region Consensus Copy No Score
View Window Spectrum for 10 mer
AAATATAAAA 11192::13188 AAATATAAAA 48 0.819
TTTTAAAATA 14636::15789 TTTTAAAATA 18 0.828
ATTTATTTAA 15831::16624 ATTTATTTAA 12 0.833
AATAAAAATA 17108::19500 AATAAAAATA 32 0.828
View Window Spectrum for 11 mer
TTATATTTAAT 9852::11359 TTATATTTAAT 34 0.848
AAAATAAAAAA 11886::13438 AAAATAAAAAA 27 0.862
TATATTTTAAA 14166::16392 TATATTTTAAA 25 0.829
ATATTAATATA 16810::19456 ATATTAATATA 20 0.841
View Window Spectrum for 12 mer
TATATTTATATA 11273::12022 TATATTTATATA 17 0.794
AAAAATTATATA 12105::12753 AAAAATTATATA 16 0.781
ATAATAAAAATA 14432::18505 ATAATAAAAATA 61 0.776
View Window Spectrum for 13 mer
TTTTATTAATATA 9754::11264 TTTTATTAATATA 43 0.796
AAATATAAATAAA 11615::13467 AAATATAAATAAA 35 0.802
TATTTTAATATAT 14272::15808 TATTTTAATATAT 18 0.838
ATATTTTAAAAAA 16449::17589 ATATTTTAAAAAA 15 0.790
View Window Spectrum for 14 mer
TTTATATTTAATTA 9947::10980 TTTATATTTAATTA 22 0.821
AAAAAATAAAAAAT 12639::13500 AAAAAATAAAAAAT 19 0.816
ATATTTTAATATAT 14347::15365 ATATTTTAATATAT 13 0.830
View Window Spectrum for 15 mer
ATTAAATTTATATTT 9970::10768 ATTAAATTTATATTT 15 0.836
AAAAAATAAAAAATA 12154::13694 AAAAAATAAAAAATA 18 0.822
TATTTTAATATATAT 14124::14790 TATTTTAATATATTT 12 0.856
View Window Spectrum for 16 mer
TTAATTAATTTATTAT 9637::11077 TTAATTAATTTATTAT 34 0.787
AAAATATAAATAAATA 12410::13184 AAAATATAAATAAATA 15 0.787
ATATTTTAATATATAT 14133::15134 ATATTTTAATATATAT 15 0.821
ATAATAAAAAAAGTAA 16129::17763 ATAATAAAAAAAGTAA 12 0.781
View Window Spectrum for 18 mer
TATTATATTTAATTAATA 9501::10254 TATTATATTTAATTAATA 17 0.820
TATTATATTTTATTTTTA 13816::14653 TATTATATTTTATTTTTA 10 0.811
View Window Spectrum for 19 mer
ATTATTATATATTTTATTT 13706::17632 ATTATTATATATTTTAt/aTT 12 0.816
View Window Spectrum for 20 mer
TATATTTTAATTAATTAAAT 9555::10195 TATATTTTAATTAATTAAAT 15 0.783
ATTATTATATTTTATTTTTA 13515::14378 ATTATTATATTTTt/aTTTTTA 12 0.779
View Window Spectrum for 21 mer
TTTAAATATTATATATTTATT 9501::10298 TTTAAATAt/aTATATATTTATT 16 0.798
ATATATTTATTATATTTTAAT 13469::14638 ATATATTTATTATATTTTAAT 11 0.805
View Window Spectrum for 22 mer
TTAAATATTATATATTTATTAA 9501::10358 TTAAATATTATATATTTATTAA 14 0.808
AATAAAAAAAAATATATTAATA 10485::14308 AATAAAAAAAAATATATTAATA 13 0.797
View Window Spectrum for 23 mer
TTAATTAAATAATTTATATTTAA 9501::11405 TTAATTAATTAATTTATATTTAA 12 0.815
View Window Spectrum for 24 mer
TATAATAATTAATTAAATTATTTT 9501::10795 TATAATAATTAATTAAATTATTTT 18 0.782
View Window Spectrum for 25 mer
AATTAATTAAATAATTTATATTTAA 9501::12055 AATTAATTAATTAATTTATATTTAA 14 0.783