ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
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1740 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
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| ParaPep ID | 1740 | ||||||||||||||||
| PMID | 20615879 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2010 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | SDLGAVISLLWGRQLFA | ||||||||||||||||
| LENGTH | 17 | ||||||||||||||||
| NAME | Small hydrophobic peptide-1 L | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
| Disease | African sleeping sickness | ||||||||||||||||
| Assay | Microscopy (Trypan blue dye viability assay) | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Trypanosoma brucei brucei Lister 427 (MiTat 1.2) | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | 10-20% dead cells at ~10μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | 0% hemolysis at 240μM | ||||||||||||||||
| Nature | Trypanocidal | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
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| DSSP states | CCHHHHHHTTSSBTTBC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c(C)c1CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
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