ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
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1632 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
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| ParaPep ID | 1632 | ||||||||||||||||
| PMID | 23116712 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2012 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | FLPAALAGIGGILGKLF | ||||||||||||||||
| LENGTH | 17 | ||||||||||||||||
| NAME | Temporin-SHd | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Amidation | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
| Disease | African sleeping sickness | ||||||||||||||||
| Assay | FACScan flow cytometer staining with propidium iodide | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Trypanosoma brucei gambiense MHOM/Cl/86/DAL967 (procyclic form) | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | IC50~22 μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | LC50 44 μM | ||||||||||||||||
| Nature | Antimicrobial | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
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| DSSP states | CCCTTTSBTTBSSCSCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
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