ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
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1378 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
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| ParaPep ID | 1378 | ||||||||||||||||
| PMID | 18984589 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2009 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | akklohalhoallalohlahollakk | ||||||||||||||||
| LENGTH | 26 | ||||||||||||||||
| NAME | D-HALO-rev | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Amidation | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | D | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | O=ornithine | ||||||||||||||||
| Disease | Malaria | ||||||||||||||||
| Assay | PLDH assay | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Plasmodium falciparum 3D7 | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | IC50=0.1 μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | HC50=716.8μM | ||||||||||||||||
| Nature | Histidine-rich amphipathic cationic peptides | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
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| DSSP states | CCSSSCCCCCCTTTCSSSSCSSCCCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
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