Detailed description page of ParaPep |
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1333 details |
Primary information | |||||||||||||||||
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ParaPep ID | 1333 | ||||||||||||||||
PMID | 20615879 | ||||||||||||||||
YEAR | 2010 | ||||||||||||||||
SEQUENCE | SDLGAVISLLLWGRQLFA | ||||||||||||||||
LENGTH | 18 | ||||||||||||||||
NAME | Small hydrophobic peptide-1 | ||||||||||||||||
C-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
Disease | African sleeping sickness | ||||||||||||||||
Assay | Microscopy (Phase-contrast) | ||||||||||||||||
Parasite Type | Trypanosoma brucei brucei Lister 427 (MiTat 1.2) | ||||||||||||||||
In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
Activity | ~60% dead cells at ~10μM | ||||||||||||||||
Hemolysis | 0% hemolysis at 240μM | ||||||||||||||||
Nature | Trypanocidal | ||||||||||||||||
Secondary information | |||||||||||||||||
STRUCTURE |
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DSSP states | CCGGGTSGGGGTSSSCCC | ||||||||||||||||
SMILES | N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c(C)c1CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O | ||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||
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