ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
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1313 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
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| ParaPep ID | 1313 | ||||||||||||||||
| PMID | 19584534 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2009 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | rlrlrigrr | ||||||||||||||||
| LENGTH | 9 | ||||||||||||||||
| NAME | Nonamer peptide B (D-amino acids) | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Amidation | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | D | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
| Disease | African sleeping sickness | ||||||||||||||||
| Assay | Cell numbers counted by Z1 Coulter Counter | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Trypanosoma brucei brucei GUTat3.1 | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | MIC=90±31 μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | Not reported | ||||||||||||||||
| Nature | Antimicrobial | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
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| DSSP states | CCSSSSCCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@H](CCCN=C)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCN=C)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCN=C)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CCCN=C)C(=O)N[C@H](CCCN=C)C(=O)N | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
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