ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
Detailed description page of ParaPep |
| This page displays user query in tabular form. |
1311 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ParaPep ID | 1311 | ||||||||||||||||
| PMID | 21517904 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2011 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | KWKSFIKKLTSAAKKVVTTAKPLISS | ||||||||||||||||
| LENGTH | 26 | ||||||||||||||||
| NAME | CP-26 | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Amidation | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
| Disease | African sleeping sickness | ||||||||||||||||
| Assay | Alamar Blue assay | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Trypanosoma brucei 427 (blood stage form) | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | IC50=1.7 μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | Not reported | ||||||||||||||||
| Nature | Antimicrobial | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
| ||||||||||||||||
| DSSP states | CCGGGHHHHHHHHHHHTTTSCCSCCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c(C)c1CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||