Detailed description page of ParaPep |
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1297 details |
Primary information | |||||||||||||||||
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ParaPep ID | 1297 | ||||||||||||||||
PMID | 21517904 | ||||||||||||||||
YEAR | 2011 | ||||||||||||||||
SEQUENCE | RGFRKHFNKLVKKVKHTISETAHVAKDTAVIAG | ||||||||||||||||
LENGTH | 33 | ||||||||||||||||
NAME | Stomoxyn | ||||||||||||||||
C-ter Modification | Amidation | ||||||||||||||||
N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
Disease | African sleeping sickness | ||||||||||||||||
Assay | Alamar Blue assay | ||||||||||||||||
Parasite Type | Trypanosoma brucei 427 (procyclic form) | ||||||||||||||||
In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
Activity | IC50=113 μM | ||||||||||||||||
Hemolysis | HC50 113 μM | ||||||||||||||||
Nature | Antimicrobial | ||||||||||||||||
Secondary information | |||||||||||||||||
STRUCTURE |
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DSSP states | CCTHHHHHHHHHHHTTTCCSSCCSSCCSSSSCC | ||||||||||||||||
SMILES | N[C@@H](CCCN=C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N | ||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||
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