ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
Detailed description page of ParaPep |
| This page displays user query in tabular form. |
1222 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ParaPep ID | 1222 | ||||||||||||||||
| PMID | 22853877 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2012 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | NPPDHSAPLGATRPSAPPLPHVVDLPQLGP | ||||||||||||||||
| LENGTH | 30 | ||||||||||||||||
| NAME | E30 | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
| Disease | Malaria | ||||||||||||||||
| Assay | Fluorimetry (SYBR Green I) | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Plasmodium falciparum 3D7 | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | IC50=>40 μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | HC50 >40μM | ||||||||||||||||
| Nature | Antimicrobial | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
| ||||||||||||||||
| DSSP states | CCSSSSCCCSSCCCCCCSSSCCCCCSSCCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1[nH]cnc1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)O | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||