ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides
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1178 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
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| ParaPep ID | 1178 | ||||||||||||||||
| PMID | 17462586 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2007 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | VOLFPVOLFP | ||||||||||||||||
| LENGTH | 10 | ||||||||||||||||
| NAME | Gramicidin S | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Cyclic | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | O=ornithine | ||||||||||||||||
| Disease | Malaria | ||||||||||||||||
| Assay | PLDH assay | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Plasmodium falciparum 3D7 | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | IC50=1300 nM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | HC50=11μM | ||||||||||||||||
| Nature | Antimicrobial | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
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| DSSP states | CCSSSSCCCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N1[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc2ccccc2)C(=O)N2CCC[C@H]2C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc2ccccc2)C(=O)N2CCC[C@@H]2C21OO2 | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
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