ParaPep -A Database of Anti-parasitic peptides Detailed description page of ParaPep |
| This page displays user query in tabular form. |
1124 details |
| Primary information | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ParaPep ID | 1124 | ||||||||||||||||
| PMID | 20140481 | ||||||||||||||||
| YEAR | 2010 | ||||||||||||||||
| SEQUENCE | RRWQWRMKKLG | ||||||||||||||||
| LENGTH | 11 | ||||||||||||||||
| NAME | LFcin B | ||||||||||||||||
| C-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| N-ter Modification | Free | ||||||||||||||||
| Linear/Cyclic | Linear | ||||||||||||||||
| Stereochemistry | L | ||||||||||||||||
| Chemical Modification | None | ||||||||||||||||
| Disease | Amoebiasis | ||||||||||||||||
| Assay | Microscopy (Trypan blue/propidium iodide dye viability assay) | ||||||||||||||||
| Parasite Type | Entamoeba histolytica | ||||||||||||||||
| In-vivo/vitro | In vitro | ||||||||||||||||
| Activity | 18–20% of trophozoite viability at 100μM | ||||||||||||||||
| Hemolysis | Not reported | ||||||||||||||||
| Nature | Antiamoebiasis | ||||||||||||||||
| Secondary information | |||||||||||||||||
| STRUCTURE |
| ||||||||||||||||
| DSSP states | CCCHHHHTTCC | ||||||||||||||||
| SMILES | N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c(C)c1CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c(C)c1CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O | ||||||||||||||||
| External Links | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||