Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR031340339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]2VHATACSEI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR031378339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]40IRMMSLVGR DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 46 0.26
VIR031380339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]42MMSLVGRWR DRB1_0102, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.28
VIR031381339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]43MSLVGRWRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR031383339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]45LVGRWRRKG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.27
VIR031384339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]46VGRWRRKGI DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.28
VIR031387339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]49WRRKGIAVD DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 20 0.21
VIR031392339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]54IAVDFATLA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.33
VIR031396339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]58FATLAATPT DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.26
VIR031399339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]61LAATPTIEA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0426 3 0.58
VIR031405339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]67IEAWSQLVS DRB1_0402 1 0.29
VIR031448339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]110WVGRHDHQQ DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 5 0.28
VIR031449339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]111VGRHDHQQL DRB1_0703 1 0.28
VIR031465339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]127YVEFDGARV DRB1_0101, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.31
VIR031485339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]147LALRHPMLR DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.28
VIR031487339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]149LRHPMLRVQ DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 7 0.28
VIR031491339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]153MLRVQFLPD DRB1_1321 1 0.29
VIR031492339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]154LRVQFLPDG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.34
VIR031496339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]158FLPDGTQRI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107 14 0.21
VIR031563339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]225LHVDLDMQA DRB1_1107 1 0.28
VIR031575339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]237MSYRILLAD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.28
VIR031577339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]239YRILLADLA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 28 0.26
VIR031580339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]242LLADLAALY DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 7 0.21
VIR031598339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]260YTYREYRQA DRB1_0802 1 0.28
VIR031600339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]262YREYRQAIE DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817 4 0.28
VIR031603339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]265YRQAIEAEE DRB1_0801 1 0.33
VIR031607339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]269IEAEETLPQ DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 4 0.23
VIR031666339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]328LFARARARG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.29
VIR031667339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]329FARARARGI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 10 0.29
VIR031685339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]347FANVLARWS DRB1_0101, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 7 0.24
VIR031688339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]350VLARWSASS DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 10 0.21
VIR031717339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]379LVGDFTSSL DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107 16 0.27
VIR031731339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]393LTGARTAAA DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423 3 0.46
VIR031790339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]452FCPDVTEQF DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.48
VIR031803339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]465WIISQGPQV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1502 7 0.43
VIR031804339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]466IISQGPQVL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.44
VIR031825339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]487LVNWDVREG DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.28
VIR031826339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]488VNWDVREGV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
VIR031851339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]513LLRLAAGDD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1321 3 0.24
VIR031916339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]578LSYAQLRDQ DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 6 0.26
VIR031932339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]594LRAAGLRVG DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12 0.28
VIR031937339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]599LRVGDTVAV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 16 0.32
VIR031967339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]629YLPIGVDQP DRB1_0421 1 0.21
VIR031988339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]650VNLALVCGP DRB1_0804, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1327, DRB1_1328 5 0.22
VIR031990339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]652LALVCGPPC DRB1_0102 1 0.28
VIR031992339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]654LVCGPPCQV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 9 0.28
VIR032048339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]710VAHDAAMNT DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 6 0.26
VIR032054339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]716MNTVETFIR DRB1_0404, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.28
VIR032057339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]719VETFIRHFE DRB1_1304 1 0.28
VIR032060339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]722FIRHFELGA DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502 6 0.28
VIR032061339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]723IRHFELGAA DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.28
VIR032066339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]728LGAADRWLA DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3 0.22
VIR032072339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]734WLALATLEC DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 28 0.26
VIR032082339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]744MSVLDIFAA DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3 0.27
VIR032084339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]746VLDIFAALR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.23
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VIR032132339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]794MLLEVGGGR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR032149339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]811VGGDWVRPD DRB1_1304 1 0.26
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VIR032679339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]1341YRALSGYSC DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.29
VIR032691339632409 YP 004724051.1 phenyloxazolinesynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]1353VRIRANIHA DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 39 0.36
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VIR036774339633091 YP 004724733.1 monooxygenase[MycobacteriumafricanumGM041182]35LERRERLGG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 11 0.24
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