Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR021073339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]451VTGDMTSTF DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 8 0.29
VIR021077339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]455MTSTFNFAV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.30
VIR021117339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]495INRGIPYRV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.29
VIR021123339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]501YRVPDPQIM DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.30
VIR021196339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]57WVGAASLSM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 39 0.43
VIR021236339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]97YEAAFVMTV DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 7 0.30
VIR021240339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]101FVMTVPPPV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 23 0.28
VIR021241339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]102VMTVPPPVI DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR021249339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]110ITANRVLVM DRB1_0421, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.26
VIR021264339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]125FFGQNSAAI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1120, DRB1_1302 8 0.32
VIR021272339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]133IAVAEAQYA DRB1_0102 1 0.47
VIR021282339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]143MWAQDAVAM DRB1_0102 1 0.27
VIR021283339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]144WAQDAVAMY DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421 3 0.27
VIR021288339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]149VAMYGYAAA DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.27
VIR021290339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]151MYGYAAASA DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 7 0.33
VIR021291339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]152YGYAAASAS DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1307 9 0.32
VIR021293339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]154YAAASASAS DRB1_0408 1 0.24
VIR021350339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]211WLVRLLGSI DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.27
VIR021351339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]212LVRLLGSIT DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 4 0.24
VIR021355339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]216LGSITPTER DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.20
VIR021366339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]227IVRLLGQSY DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.33
VIR021367339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]228VRLLGQSYF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 20 0.32
VIR021382339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]243FFASIAQQL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 6 0.43
VIR021411339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]272FAGLGASRA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0408 3 0.55
VIR021424339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]285LARANKIGA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 9 0.33
VIR021469339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]330LLRGLPLGS DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1506 19 0.31
VIR021479339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]340ITRRSGAFA DRB1_0802, DRB1_0804 2 0.28
VIR021486339631841 YP 004723483.1 PPEfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]347FAHRYGFRH DRB1_0801 1 0.37
VIR021541339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]45VMTDPLLKV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1506 9 0.28
VIR021546339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]50LLKVVNSRL DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703 7 0.25
VIR021547339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]51LKVVNSRLR DRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.28
VIR021549339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]53VVNSRLREL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 15 0.25
VIR021570339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]74WALCLVDGA DRB1_0401, DRB1_0426 2 0.28
VIR021572339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]76LCLVDGAPL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.27
VIR021574339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]78LVDGAPLRA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.29
VIR021591339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]95VYDGDRLWI DRB1_1506 1 0.22
VIR021597339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]101LWIRFIADT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.28
VIR021598339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]102WIRFIADTE DRB1_0405 1 0.29
VIR021599339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]103IRFIADTER DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 5 0.31
VIR021612339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]116IEHISTAVA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1307, DRB1_1311 12 0.48
VIR021623339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]127LSKRFARID DRB1_0806 1 0.30
VIR021627339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]131FARIDPIVA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 12 0.29
VIR021633339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]137IVAVQVGAS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321 27 0.29
VIR021636339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]140VQVGASMVA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 10 0.30
VIR021653339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]157VLGWWRWHH DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.28
VIR021657339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]161WRWHHNTWL DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.28
VIR021678339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]182LAVAMLLLM DRB1_1128, DRB1_1305 2 0.27
VIR021680339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]184VAMLLLMRA DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1501, DRB1_1506 24 0.27
VIR021682339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]186MLLLMRAKT DRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 22 0.26
VIR021683339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]187LLLMRAKTD DRB1_0102, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 8 0.26
VIR021699339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]203IMLMSAIMP DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.28
VIR021700339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]204MLMSAIMPV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 28 0.27
VIR021702339631849 YP 004723491.1 hypotheticalproteinMAF 18170[MycobacteriumafricanumGM041182]206MSAIMPVTV DRB1_0102 1 0.26
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VIR022548339631871 YP 004723513.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]331VGNGGAGGS DRB1_1107 1 0.24
VIR022591339631871 YP 004723513.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]374LVGAGGAGG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR022681339631871 YP 004723513.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]464LVGNGGNGG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR022708339631871 YP 004723513.1 PE-PGRSfamilyprotein[MycobacteriumafricanumGM041182]491LLGKNGMNG DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817 3 0.27
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VIR025509339632017 YP 004723659.1 permease[MycobacteriumafricanumGM041182]118LRVAFPDKA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.30
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VIR031149339632376 YP 004724018.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]315VSMVTALRI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.22
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